Um die Untersuchung der Krankheitsübertragung des Impulsbeispiels der Übertragung von Affenpocken im Vereinigten Königreich zu verstehen, sprach UKHSA nachdenklich erneut mit bestätigten Fällen. Fälle wurden für erneute Befragungen begrüßt, die sich auf ihr sexuelles Wohlbefinden konzentrierten und durch Anrufe zwischen dem 25. und 30. Mai 2022 unter Verwendung organisierter Umfragen durchgeführt wurden. Von den 82 Fällen mit bekannter oder vermuteter Verbindung zur Übertragung in sexuellen GBMSM-Organisationen, die bis zum 25. Mai 2022 unterschieden wurden, nahmen 45 (55 %) an erneuten Befragungen unter Verwendung dieser speziellen detaillierten Umfrage teil. Zu den Erklärungen für die Nichtteilnahme an diesen erneuten Befragungen gehörten das Fehlen von Kontaktdetails (n = 11), die Ablehnung der Teilnahme (n = 4) und das Versäumnis, einen telefonischen Kontakt für eine erneute Befragung zu vereinbaren (n = 22). Alle ausgewerteten Fälle waren Cisgender-Männer und als schwul (n=40), sexuell unbefangen (n=4) oder auf andere Weise (n=1) gekennzeichnet.
Die Beginndaten der Nebenwirkung lagen zwischen dem 8. April und dem 20. Mai 2022, wobei alle Fälle im Mai 2022 analysiert wurden. Die Untersuchung der Anfangs-, Reise- und Szenenteilnahmedaten ergab, dass 31 (69 % von 45) mit Fällen gesprochen wurden, bei denen keine Bewegung ins Ausland Nebenwirkungen hatte Anfangstermine ab April 2022, darunter ein Fall, der sich daraufhin zu einem weltweiten Anlass wagte. Während des gesamten Mai 2022 verursachten einige Fälle, die nach einer Einreise nach Europa nach Großbritannien zurückkehrten, Nebenwirkungen.
Entdeckungen zeigen, dass Affenpocken in geologisch diffusen sexuellen Organisationen gesendet werden. Praktisch alle (98 %) der Fälle, mit denen gesprochen wurde, berichteten ausführlich über Sex mit verschiedenen Männern während des Brutzeitraums (5 bis 21 Tage). Der größte Teil (60 %, 27 von 45) hatte im Vorjahr eine sexuell übertragbare Krankheit, 44 % (20 von 45) gaben an, in den letzten 90 Tagen mehr als 10 sexuelle Komplizen gehabt zu haben, und 44 % (20 von 45). von 45) zeigten Haufensex während des Brutzeitrahmens. Sexuelle Organisationen, die an diesem Aufflammen beteiligt sind, sind sowohl innerhalb als auch außerhalb des Vereinigten Königreichs miteinander verbunden, da 30 % (13 von 45) der Fälle sexuelle Bewegungen in anderen städtischen Gemeinschaften als ihrem Wohnort detailliert beschreiben, 20 % (9 von 45) enthüllten sexuelle Handlungen im Ausland, und 24 % (11 von 45) kündigten während des Brutzeitraums sexuelle Handlungen mit Männern an, die nicht im Vereinigten Königreich ansässig sind.
Die Entdeckungen aus diesen Treffen zeigten explizite Schwierigkeiten und mögliche offene Türen für die Kontrolle des Aufflackerns.
Herkömmliche Kontaktverfolgung als wesentliche Kontrollvermittlung in dieser speziellen Versammlung wird versucht, da die meisten Fälle zeigten, dass sie sexuellen Kontakt mit neuen oder lockeren Komplizen hatten, manchmal in Bezug auf Kreuzfahrtgründe oder während Chemsex, oft wo Kontaktdetails für die Verfolgung unzugänglich waren.
Sexuelle Wohlfahrtsverwaltungen (SHS) wurden als wahrscheinliche Orte für die Übermittlung bahnbrechender Kontrollinterzessionen wie Antikörper erkannt, da es Verbindungen zwischen Personen, die von Krankheiten bedroht sind, und diesen Verwaltungen gibt. Die meisten Fälle waren negativ auf eine humane Immundefizienzinfektion (HIV) und 91 % (29 von 32) von ihnen waren mit SHS zur Durchführung einer HIV-Prä-Openness-Prophylaxe (PrEP) verbunden. Alle Fälle, die mit HIV lebten, waren an die HIV-Versorgung angeschlossen und befanden sich in Behandlung; wobei über 90 % unmerkliche Viruslasten ankündigen.
Von den Gesprächspartnern gaben 44 % (20 von 45) an, während des grüblerischen Zeitrahmens Sex-on-Premises-Szenen im Vereinigten Königreich oder im Ausland zu besuchen, wie Saunen, dunkle Räume oder Sexclubs. Auf diese Weise würde die Zusammenarbeit mit Sex-on-Premises-Szenen zur Durchführung bestimmter Vermittlungen die Episodenkontrolle aufrechterhalten. Eine Minderheit der Fälle offenbarte sexuelle Handlungen bei weltweiten Feiern oder Anlässen. Dennoch gaben 36 % (16 von 45) an, dass sie in den 3 Wochen vor Beginn der Nebenwirkung keine Sex-on-Premises-Szenen, -Feiern oder -Veranstaltungen besucht haben, und schlagen die Forderung nach umfassenderen Mediationen vor, die bei allen GBMSM in diesen Fällen anfallen sexuelle Organisationen.
Es gab eine hohe Nutzung von Geodaten-Dating-Anwendungen, mit 64% (28 von 45) der Fälle, in denen während des grüblerischen Zeitraums neue Komplizen gefunden wurden, die solche Anwendungen nutzten, was zeigt, dass dies wahrscheinlich hilfreiche Phasen sind, um Botschaften zur Verbesserung des Wohlbefindens zu verbreiten oder innovative Wege zu unterstützen Umgang mit Kontakt nach.
Entdeckungen aus diesen frühen Umfragen zum sexuellen Wohlbefinden weisen einige Einschränkungen auf. Potenzielle Fälle, die an Interviews teilgenommen haben, haben ein anderes sexuelles Verhalten und gehen eine Chance ein als die Personen, die die Unterstützung abgelehnt haben. Bei der Betrachtung von Fällen, in denen mit und nicht gesprochen wurde, gab es keine großen Unterschiede in Bezug auf Alter, Wohnort oder angekündigte Reisegeschichte. Ungeachtet dessen werden diese Entdeckungen wahrscheinlich nicht die gesamte Episode veranschaulichen, da sie eine Neigung zur Unterstützung haben und Beispiele für die Übertragung entwickeln, was ihre Verallgemeinerbarkeit beeinflusst. Untersuchungen aus fortschreitenden Fallbesprechungen werden zeigen, ob sich diese Beispiele ändern; zum Beispiel das Ausmaß der Fälle, in denen keine sexuelle Bewegung oder Teilnahme an Feiern und Einstellungen gemeldet wird.
Abschnitt 3. Genomik
3.1 Sequenzierung und Bioinformatik
Monkeypox codiert ein etwa 197 kb großes Basenpaar twofold aufgegebenes Desoxyribonukleinsäure (DNA)-Genom mit einem typischen Guanin-Cytosin-Gehalt (GC) von 33 %. Es enthält 190 Codierfolgen. Affenpocken-Genome haben einen überwachten zentralen Bereich mit Haushaltsqualitäten, wobei sich das Rüschengenom an den Enden befindet und an jedem Ende eine gewöhnliche neu angeordnete abschließende Wiederholung vorliegt.
Die Genomstruktur der Affenpocken stellt einige Schwierigkeiten für eine exakte Wiederherstellung dar; das Genom enthält einen langen (ungefähr 6,5 kb) Reverse-Pair-Rehash, der schwer in einzelne Duplikate zu bestimmen ist, wobei sich Short Read nähert. Die niedrige GC des Genoms führt zu langen Poly-A/T-Homopolymer-Chargen, deren präzise Nachfolge schwierig sein kann. Darüber hinaus werden Nachbarschaftspaar-Wiederaufwärmungen über das Genom verteilt, was zu Schwierigkeiten beim Zusammenkommen führen kann.
Die träge Entwicklungsrate und der späte normale Vorgänger der laufenden Episode machen die genomische Untersuchung der Krankheitsübertragung über kurze Zeiträume hinweg von einer soliden Neugestaltung der Anordnung für präzise Schlussfolgerungen abhängig: Dies kann aufgrund der verstandenen Länge oder Übereinstimmung höher sein als die erreichbare Genauigkeit der Sequenzierungsstadien Genauigkeit und erfordern Charakterisierung und übliche Genehmigung. Eine zusätzliche Sorge für die genomische Untersuchung der Krankheitsübertragung ist das Potenzial für Vielfalt sowohl innerhalb als auch zwischen Wunden. Die Charakterisierung dieser Sorte ist von grundlegender Bedeutung, um die Verwendung in Bezug auf die Genomik bei der Untersuchung des Aufflammens zu beraten.
Eine exakte Genomreproduktion beruht auf der Erzielung einer angemessenen Tiefe und Ausdehnung des Einschlusses. Bis zu diesem Zeitpunkt wurden Genomfolgen im Wesentlichen durch metagenomische Ansätze erzeugt, die die Elemente in einem klinischen Beispiel gruppieren, ohne sich darauf zu konzentrieren. Die Erreichbarkeit von metagenomischen Ansätzen zur Herstellung hilfreicher Gruppierungen wird normalerweise durch das Verhältnis von Wirt zu Infektionsperusen in dem Beispiel eingeschränkt, das durch außergewöhnlich tiefgreifende Sequenzierungsansätze etwas gemildert werden kann.
Britische Erfahrungen deuten darauf hin, dass mit dieser Methode eine gute Genomintegration bis zu einem Zyklusrand (Ct) von etwa 20 erreicht werden kann, wobei fraktionierte Genome bis zu einem Ct von 25 zu sehen sind. Dies bedeutet, dass es nicht möglich ist, alle Fälle zu verwenden diese Methodik. In Zukunft könnten bestimmte Techniken, zum Beispiel Köderfang- oder Amplikon-Strategien, die Option haben, die Reaktionsfähigkeit der Sequenzierung zu erhöhen und somit den Ertrag aus der Sequenzierung zu erhöhen. Da Metagenomik-Strategien jedoch nicht zielgerichtet sind, können sie positiv sein, während die Episodenvielfalt zweifelhaft bleibt. Andere tatsächliche Verbesserungsmaßnahmen könnten das Bewusstsein für Metagenomik steigern. Eine Verbesserung kann auch durch kulturelle Abgeschiedenheit erreicht werden, aber dies kann zu falschen Transformationen führen und wird nicht als die wesentliche Methode empfohlen.
In Anbetracht dieser Probleme schlagen wir Folgendes vor:
Sowohl die Gruppierung gelesener Informationen als auch Vereinbarungen sollten gemeinsam genutzt werden, um stabile bioinformatische Ansätze zu ermöglichen
Ein vernünftiger Weg, um mit Abweichungen umzugehen, der fordert, sich von tristen und wenig komplizierten Bezirken fernzuhalten, sollte genutzt werden
Bioinformatik-Ansätze sollten auf explizite Informationstypen abgestimmt und zwischen Testanordnung, Sequenzierungsstufen und Erfassungstechniken kreuzgeprüft werden
Eine gemeinsame epidemiologische und genomische Untersuchung wird voraussichtlich fein skalierte Phylogenien mit Sicherheit entschlüsseln.
Der Austausch genomischer Informationen in Großbritannien mit der Genbank wurde eingeleitet.
3.2 Biologische Auswirkungen der Genomentdeckungen
Der laufende britische Affenpockenstamm enthält 48 einzelne Transformationen in seinem Genom, das mit dem britischen Affenpockenstamm von 2018 verglichen wird. 27 dieser Transformationen sind insofern leise, als sie keines der viralen Proteine verändern. 21 der Transformationen verursachen Veränderungen in viralen Proteinen.
Aufgrund der bekannten Leistungsfähigkeit der viralen Proteine stufen wir die Veränderungen nach unserer Einschätzung in einen geringen, mittleren und hohen Untersuchungsbedarf ein. Diese Einschätzungen hängen von den Auswirkungen der vollständigen Aufhebung dieser Proteine durch die Infektion ab. Es ist wichtig zu betonen, dass wir derzeit die Auswirkungen einzelner Änderungen im Gegensatz zu vollständigen Proteinlöschungen nicht vorhersehen können. Es gibt 2 Änderungen mit geringem Bedarf:
Bei mittlerem Bedarf gibt es 4 Änderungen:
B21/B22 (D209N, P722S, M1741I): T-Zell-Inhibitor, der auch in Kuhpocken, Kamelpocken und Pferdepocken aufgespürt wurde, das Einbringen dieses Proteins in unschädliche Kuhpockenstämme erhöhte die Schwere der Krankheit und die Sterblichkeit bei Nagetieren.
Während aufflammende Clade-Veränderungen über das Genom verbreitet werden, gibt es eine kleine Untergruppe von Transformationen in Proteinen, die mit der Übertragung von Infektionen, der Zerstörung oder der Kommunikation mit antiviralen Medikamenten zu tun haben. Primäre Demonstration ist erforderlich
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